CDS
Accession Number | TCMCG015C13919 |
gbkey | CDS |
Protein Id | XP_027108721.1 |
Location | join(9123991..9124724,9124799..9125534,9126816..9127310,9127963..9128068,9128162..9128172,9128368..9128502,9128628..9128759,9128762..9131977,9132188..9132400,9132687..9132890,9133059..9133262,9134151..9134309,9134844..9135194,9137010..9137243) |
Gene | LOC113728521 |
GeneID | 113728521 |
Organism | Coffea arabica |
Protein
Length | 2309aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA506972 |
db_source | XM_027252920.1 |
Definition | LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC113728521 [Coffea arabica] |
EGGNOG-MAPPER Annotation
COG_category | S |
Description | Ribosome 60S biogenesis N-terminal |
KEGG_TC | - |
KEGG_Module | - |
KEGG_Reaction | - |
KEGG_rclass | - |
BRITE |
ko00000
[VIEW IN KEGG] ko01000 [VIEW IN KEGG] ko03009 [VIEW IN KEGG] |
KEGG_ko |
ko:K07766
[VIEW IN KEGG] ko:K14861 [VIEW IN KEGG] |
EC |
3.6.1.52
[VIEW IN KEGG]
[VIEW IN INGREDIENT] |
KEGG_Pathway | - |
GOs | - |
Sequence
CDS: ATGGGGGATTTGTACGAGGAGTTGAACAGTAAAGTGGCGAAAAGGCAGAAAGCTGTCTTGTTGTTGTTGGCTTCTATAGTTAGGCGTGGGCCGGGTTTGGCGTGGGAGGTGGCAAAGGGTTTTGATTTTAAAACTGGGAATTTCTCCAAGCTTGCTGAGTGGAAGGCGAGGGGGAATGAGGGGATGAGGAGGTATTTGACGAGGAAGGAATTTGTTGGTTTTGCTATGTCATTTTTGGAAGTGGGGAATCCGCGGCTGTTGAGAGGGATTTTGCAGCAGAAGGATATGTATTCAGGGGTGCTTCGTGGGTTGGGAAATGATGATGAGGAGATTGTGGTTTATGTTCTTCTGACGTTGCGGAATAGAGTACTTGTCCCGGAGTCGTTGGTGCCTCCGGGCCTAAGAAGCGTGTTGTTTGGGAGTGCTACTCTGGAGCAATTGATAAGCATTTCAGGGAGGCAGGATGGTGGGCTTGCTGCTGAGGTGGCGCATAGTGTGCTAGTAATGGTGTGTACGGATCCTTCTAACGGGTTGATGCCAGATTTAGAGAGGCAGCCTAATCCTTTGAAGGGAAATGTGAAGCGATTAGTGGATCTTATGAAGAAGCTCAAACCCACAGAGGTTGAGTACCACAAAGACCTGCTTTTGGCCATTGTAAAAGGGAGGCCGGCCTTTGGGTCAGCATACTTGGAGAACTTCCCTCATAATCTTGAAGACCTGGCATCACCTAACTGGTTTTCTGCTATTTCTCTGGCTGCAGATGTCATGTCCTCAGTTGGTGATGGATTTACATGTGCCTATGTTAACTCTCAGTCTCAGGAGCCCCCATCCATTGACAATCTGATAGTCCAAGACATTATGAAGTGCATAGGGCCACGCCCATTCACCCGATTGGTAATGAATAAAGGGTTGCTTCACTCTGATCCTCTTGTGAAACATGTAACTCTGAGGCTTGTATCGGAGGAACTAAAGCTTCTCGACTTTTTAATTGGCTCTGTAAATGATCTGTCCAGTTCCAGTGATCAAGTGATGCATAAGTGGGCATCTTTCAAGCGAGATGTTCAGAATGTAGTCCAGATTTTACTTCCTGATCCCCAGGTGCTATTATCACTACTTTCTTCACTCAGTGGCTACTGCAAGAGTCCTGCATCAAGAATGAAGAGGGCTGCAGATGTAGATGTTACAGTCGAGCATAATTTGCACAAGAAGAAGAAGTTGAAGATGAATAGCGTGGATGAGGACATGGATATTCTCGTCAGTGGGGTTAGTTCAACCACTGAAGGGGCTTTGACTGAGAATGATGGAGTGTCAGAAGAGGATGTTGAGGATCAGCTGAATAGTGGAGTTGACCTCCTGAAACCTGTTCTAGAAATTTGGGGTTTGCAGGGATGCTCCAGTGTAGATATCAGAACTGAAGATGGGGACACATACTTTTACTCAAAGTTGCTTGATGTTCTCAGAATTTATCATCGGACTCTGCCTACTGCTGTGGAAGGATCATTTGACTTCTTTAAAGTTCTCCCAAGCAATCCTTTAGCACTACCTACAATTTTGCAGCAGTCTATGCTGTCACTGCTTGTAGAACAAGTTGTTGGGTCCAACAAGTCTCAGATTTCCATCAGAACCCAACCATTGATGTACAAGTATCTTCATTCATTTATCAATTTGTTTATGTATTCACCAATAAGAGACATAAAAGATCAGGCTTACTCTTTAGCACAAGCAGCCATGTTGAGTACAGGTGCATTTGACAGAAATCCAAGGGAAATTTCTGCTTGGTTTCTATTTATACCTGGCTATACCAGTGTGGTTATTGATGGTCAAAAACATGGGATTGAAGTATTCCAAAAGTTGTCTTCAGTTGTCATCTCTTTTCTTTGCGATGCAGTTTCTACTACTGGGAACAACTTGTTCAAATATTTGGATCTCTTAAGGGGCTATATCCGTGATTTAGAGTTTCTACAGGTTTGGGTTTTGTTGGTGGATTTACATGGTGAAAGGTTTACTAGTGGTTCTATATGGAAAACACAGACCCTCTCTGTTTATTTAAGGCTGCTGTTGACTGACTCAGCTATTTTAGCTCCCTTTCATAGTTTGTGTACTGGAGAGAAGTGCTTGAGGTTACTTAGCTCTGAAACTGGTTCTTTTACATTGCCCGAGAAGTCAATGATATCATTGTATGTTTCTACCACATTAAAGTATCTCCTGGAAACTCAGGTTGAAGGTGGACTTTTGTGTTCCCTGACGCAGCTTTTGATATCAGAGAGACTTAAAGGTTGTTGCGATATGATTGGATTCTGCCCTTGTGAATGGATGCCGATGAATAGTTTGTTATATTTTGCAAGGAATGTGCAGCAACAAATTTATAGCAGTTTTATGTCTGAAGAGAAAGCTACTGGTCTTGGTGGTTCATTTTCTGAGACACTTTCTGAAGTTAATAGGATTTTAAGGACTAAGGATCATTGTGGGTTGCTTGGAGTTACTATGGGGTTTTCTTTTTCAATGATATGCACCACAGCTGATCAGATATTGCAGAATTTCCCATCGACCATCTCTACTTCTACTAAATTGCTTGGGGTTCCTTTCTCAATTTTGTTGTTGAGATTCTTTCTCGAACCAAGTCATTTTGCTGAAGTTTTCAAGTTATGGCCTAAAATATGCTTTGCTGGAGTTGACAAAGTTATAAGTGGAGTTCATGATGGAGAAGGGCAGACAATAGCTAATGAGCTTGATGATTCACCAGATTCTGCTTCTATTGCATTCTCTTTTTTAGTAAAGAATGCTCCTTTTCATGTGCTCTTTCCAGCTATTTTTTTCACTGATGGATTGCATTTGCTTGGTCACTCAAAAGTGCAGAATTTGCTTCTGGATAAATTCACTGAGAGTACACCTGACTTCTCTGTCTCTTCTCTCTGCCGTCTTCTCTTTTGCTTGCTTCAAGCGCGATTGGCCTATAGAATCAAACCATCTGATGAACTTGAAAAACTTTGTGAATCATCTTGTTTTCTTGCAAAGCACATAGTAAAACAATCATTTGTTGAAAAATTTGGTCCTGATTGCTCCCCGCGTGTTTTGCCTCCTTTATCATCTGGTCATATTCGAGAAGTGGCTGAAATAATTCTTGGCCACCCTTTACTCACTGCATTGCTGGAATGGCCTTTGCATACCGATAATGATGTTGGTGACATGATTTTTATGAAACCTCCAGAAACCTTTCTTCAGTATGCTGAACGGGGTGTTCGTAAAATAGATCATCATATTTTGCAGTTGTTAAGAAGAACCACATCTGAGCTTTTGGTTCATGTATTTAGTAAATGTAGATCACCATCTGTGGTTGATCATTCTACTGAACGGATTGCAAAGGCTTTCAAGGCTCTGGTGCAGAAGCTATTTTTGACATTTAAGGCGAGGTTCACAGATTCCAGAAAGACAGATGATTTGATGCCTCTAATTCCTACATTGTATGCTTTGCATAGTCTGAGTGAATTCATATGTCCCTTTGAGTTGCTCAATTTGGTGCACTGGTTGTTCTCCAGAATTGATCTAAATGATACTGCAGTTTCCATTTCTTGTCAAAGATGTGGTTTGTCTGTTGGATTACAAATTGCTTCATGGGCTTTTGATTCTCTTTCTTTATATATGTTAGAGCCACATGCAAAGAGGACATTATTCAATTTCTTTATGGGTACTGGAAACAGAAGTTTTGAAATTACCCTTTTTGAGAGAATTTTTAACAGCATATTTGAGATTGCCACTCACACTCAACTAGAAGTTGCTGATATATGTTTATTCAAAGCTGTTAAGATCATCAAAATGCATAAATGTATGGAGAAGACCAGCTTACCTTTTGTTATGGCTACTTCAAGACTTCTACCCAGTGTTCCTGTGAACTTTATTTCTTATTGCTTGGACAAGACAACCAAGACTAAGTGTGACTTCTTGTTTCTTCTGTCTGAGATGAGCTCCCTGCATCTTTGTGTATTTGGACATTTGGTTTCTGGTAAAATTAGTAATAATCAAGCTCTTAAGGTCAACAAGGAAGAAAACTGCAATCGGCCTCAGTACTCTGAAGAGTTCTTGATGCTTCTGCCAACTGTTCTGTTATACTTGAGGTCAAATTTTCTGAAATTTGGGGGCCAATTTGGCAAGCATGTTGAAAACACTTCTTCTTTCTTTTGGAAGATCCTTTTGCGTGGTTTCTCTAACTGGAAGAGTTTTGTTTCGGAAGAGATATTTGAGATAAAACTTGTTGAGTGCTCATCTTTATGCATGGAAGATTTTTCTAACCTTTTCTCTTCCAGTCTTCTTGGAAAAGCAGTACTGCTGATGCGTCATTACCTTGCTGTGAGTGGACACTTGGTGAAAATGAAAAGGCTATTGAGTACATTTGATTCTGTTTGCCCACATGCGAGTGCACAGAATGATCTTCTGGACTGCGATGCTAGAGAAATTGGTGTTTGTTCTCTTGAGTTGTCTTTGAACTTTGTGAACAAAATTATTGCAAAGATATGCCTCTGTTGGATGTTGTTATTTCCAGAGCATAATAATCTTCAATCTGTAGTGAAAGATGGAAAGAAAAAAGGAATTGAATCAGAAGTTAGCATTTTGAGAATCCGATTTTTAAGTATGCTGGTCCATTCATGGCAACGTCTTGTGGAGAATTTTCATACATGCAGGCAAGGAGAGAACATAAGGTCGTCATTGTTTAGATTCTTGGAGATCTTCATTGCTAAGAATATAGTAGCATTGGTAAGAGAAATGCATGATTGCCTGGTTGAATTGCATTCGCTTCCTTTCTTAGACCAACTTGCCAAATATTCTCTTCTTCATAGGTTTGATGACCCTACCACAATTAGGATGCTTAGAATTGTTCTTATTTCACTATCTGAGGGAAAGTTCTTGTGCATTTCAATTCTCCAGCTGTTACTTGCTCACTCTCAATTTGCTCCAACCATTCTATTTGCCCATTCATCAACTGTTTGTACTCAATTTGGTATGAG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