CDS

Accession Number TCMCG015C13919
gbkey CDS
Protein Id XP_027108721.1
Location join(9123991..9124724,9124799..9125534,9126816..9127310,9127963..9128068,9128162..9128172,9128368..9128502,9128628..9128759,9128762..9131977,9132188..9132400,9132687..9132890,9133059..9133262,9134151..9134309,9134844..9135194,9137010..9137243)
Gene LOC113728521
GeneID 113728521
Organism Coffea arabica

Protein

Length 2309aa
Molecule type protein
Topology linear
Data_file_division PLN
dblink BioProject:PRJNA506972
db_source XM_027252920.1
Definition LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC113728521 [Coffea arabica]

EGGNOG-MAPPER Annotation

COG_category S
Description Ribosome 60S biogenesis N-terminal
KEGG_TC -
KEGG_Module -
KEGG_Reaction -
KEGG_rclass -
BRITE ko00000        [VIEW IN KEGG]
ko01000        [VIEW IN KEGG]
ko03009        [VIEW IN KEGG]
KEGG_ko ko:K07766        [VIEW IN KEGG]
ko:K14861        [VIEW IN KEGG]
EC 3.6.1.52        [VIEW IN KEGG]        [VIEW IN INGREDIENT]
KEGG_Pathway -
GOs -

Sequence

CDS:  
ATGGGGGATTTGTACGAGGAGTTGAACAGTAAAGTGGCGAAAAGGCAGAAAGCTGTCTTGTTGTTGTTGGCTTCTATAGTTAGGCGTGGGCCGGGTTTGGCGTGGGAGGTGGCAAAGGGTTTTGATTTTAAAACTGGGAATTTCTCCAAGCTTGCTGAGTGGAAGGCGAGGGGGAATGAGGGGATGAGGAGGTATTTGACGAGGAAGGAATTTGTTGGTTTTGCTATGTCATTTTTGGAAGTGGGGAATCCGCGGCTGTTGAGAGGGATTTTGCAGCAGAAGGATATGTATTCAGGGGTGCTTCGTGGGTTGGGAAATGATGATGAGGAGATTGTGGTTTATGTTCTTCTGACGTTGCGGAATAGAGTACTTGTCCCGGAGTCGTTGGTGCCTCCGGGCCTAAGAAGCGTGTTGTTTGGGAGTGCTACTCTGGAGCAATTGATAAGCATTTCAGGGAGGCAGGATGGTGGGCTTGCTGCTGAGGTGGCGCATAGTGTGCTAGTAATGGTGTGTACGGATCCTTCTAACGGGTTGATGCCAGATTTAGAGAGGCAGCCTAATCCTTTGAAGGGAAATGTGAAGCGATTAGTGGATCTTATGAAGAAGCTCAAACCCACAGAGGTTGAGTACCACAAAGACCTGCTTTTGGCCATTGTAAAAGGGAGGCCGGCCTTTGGGTCAGCATACTTGGAGAACTTCCCTCATAATCTTGAAGACCTGGCATCACCTAACTGGTTTTCTGCTATTTCTCTGGCTGCAGATGTCATGTCCTCAGTTGGTGATGGATTTACATGTGCCTATGTTAACTCTCAGTCTCAGGAGCCCCCATCCATTGACAATCTGATAGTCCAAGACATTATGAAGTGCATAGGGCCACGCCCATTCACCCGATTGGTAATGAATAAAGGGTTGCTTCACTCTGATCCTCTTGTGAAACATGTAACTCTGAGGCTTGTATCGGAGGAACTAAAGCTTCTCGACTTTTTAATTGGCTCTGTAAATGATCTGTCCAGTTCCAGTGATCAAGTGATGCATAAGTGGGCATCTTTCAAGCGAGATGTTCAGAATGTAGTCCAGATTTTACTTCCTGATCCCCAGGTGCTATTATCACTACTTTCTTCACTCAGTGGCTACTGCAAGAGTCCTGCATCAAGAATGAAGAGGGCTGCAGATGTAGATGTTACAGTCGAGCATAATTTGCACAAGAAGAAGAAGTTGAAGATGAATAGCGTGGATGAGGACATGGATATTCTCGTCAGTGGGGTTAGTTCAACCACTGAAGGGGCTTTGACTGAGAATGATGGAGTGTCAGAAGAGGATGTTGAGGATCAGCTGAATAGTGGAGTTGACCTCCTGAAACCTGTTCTAGAAATTTGGGGTTTGCAGGGATGCTCCAGTGTAGATATCAGAACTGAAGATGGGGACACATACTTTTACTCAAAGTTGCTTGATGTTCTCAGAATTTATCATCGGACTCTGCCTACTGCTGTGGAAGGATCATTTGACTTCTTTAAAGTTCTCCCAAGCAATCCTTTAGCACTACCTACAATTTTGCAGCAGTCTATGCTGTCACTGCTTGTAGAACAAGTTGTTGGGTCCAACAAGTCTCAGATTTCCATCAGAACCCAACCATTGATGTACAAGTATCTTCATTCATTTATCAATTTGTTTATGTATTCACCAATAAGAGACATAAAAGATCAGGCTTACTCTTTAGCACAAGCAGCCATGTTGAGTACAGGTGCATTTGACAGAAATCCAAGGGAAATTTCTGCTTGGTTTCTATTTATACCTGGCTATACCAGTGTGGTTATTGATGGTCAAAAACATGGGATTGAAGTATTCCAAAAGTTGTCTTCAGTTGTCATCTCTTTTCTTTGCGATGCAGTTTCTACTACTGGGAACAACTTGTTCAAATATTTGGATCTCTTAAGGGGCTATATCCGTGATTTAGAGTTTCTACAGGTTTGGGTTTTGTTGGTGGATTTACATGGTGAAAGGTTTACTAGTGGTTCTATATGGAAAACACAGACCCTCTCTGTTTATTTAAGGCTGCTGTTGACTGACTCAGCTATTTTAGCTCCCTTTCATAGTTTGTGTACTGGAGAGAAGTGCTTGAGGTTACTTAGCTCTGAAACTGGTTCTTTTACATTGCCCGAGAAGTCAATGATATCATTGTATGTTTCTACCACATTAAAGTATCTCCTGGAAACTCAGGTTGAAGGTGGACTTTTGTGTTCCCTGACGCAGCTTTTGATATCAGAGAGACTTAAAGGTTGTTGCGATATGATTGGATTCTGCCCTTGTGAATGGATGCCGATGAATAGTTTGTTATATTTTGCAAGGAATGTGCAGCAACAAATTTATAGCAGTTTTATGTCTGAAGAGAAAGCTACTGGTCTTGGTGGTTCATTTTCTGAGACACTTTCTGAAGTTAATAGGATTTTAAGGACTAAGGATCATTGTGGGTTGCTTGGAGTTACTATGGGGTTTTCTTTTTCAATGATATGCACCACAGCTGATCAGATATTGCAGAATTTCCCATCGACCATCTCTACTTCTACTAAATTGCTTGGGGTTCCTTTCTCAATTTTGTTGTTGAGATTCTTTCTCGAACCAAGTCATTTTGCTGAAGTTTTCAAGTTATGGCCTAAAATATGCTTTGCTGGAGTTGACAAAGTTATAAGTGGAGTTCATGATGGAGAAGGGCAGACAATAGCTAATGAGCTTGATGATTCACCAGATTCTGCTTCTATTGCATTCTCTTTTTTAGTAAAGAATGCTCCTTTTCATGTGCTCTTTCCAGCTATTTTTTTCACTGATGGATTGCATTTGCTTGGTCACTCAAAAGTGCAGAATTTGCTTCTGGATAAATTCACTGAGAGTACACCTGACTTCTCTGTCTCTTCTCTCTGCCGTCTTCTCTTTTGCTTGCTTCAAGCGCGATTGGCCTATAGAATCAAACCATCTGATGAACTTGAAAAACTTTGTGAATCATCTTGTTTTCTTGCAAAGCACATAGTAAAACAATCATTTGTTGAAAAATTTGGTCCTGATTGCTCCCCGCGTGTTTTGCCTCCTTTATCATCTGGTCATATTCGAGAAGTGGCTGAAATAATTCTTGGCCACCCTTTACTCACTGCATTGCTGGAATGGCCTTTGCATACCGATAATGATGTTGGTGACATGATTTTTATGAAACCTCCAGAAACCTTTCTTCAGTATGCTGAACGGGGTGTTCGTAAAATAGATCATCATATTTTGCAGTTGTTAAGAAGAACCACATCTGAGCTTTTGGTTCATGTATTTAGTAAATGTAGATCACCATCTGTGGTTGATCATTCTACTGAACGGATTGCAAAGGCTTTCAAGGCTCTGGTGCAGAAGCTATTTTTGACATTTAAGGCGAGGTTCACAGATTCCAGAAAGACAGATGATTTGATGCCTCTAATTCCTACATTGTATGCTTTGCATAGTCTGAGTGAATTCATATGTCCCTTTGAGTTGCTCAATTTGGTGCACTGGTTGTTCTCCAGAATTGATCTAAATGATACTGCAGTTTCCATTTCTTGTCAAAGATGTGGTTTGTCTGTTGGATTACAAATTGCTTCATGGGCTTTTGATTCTCTTTCTTTATATATGTTAGAGCCACATGCAAAGAGGACATTATTCAATTTCTTTATGGGTACTGGAAACAGAAGTTTTGAAATTACCCTTTTTGAGAGAATTTTTAACAGCATATTTGAGATTGCCACTCACACTCAACTAGAAGTTGCTGATATATGTTTATTCAAAGCTGTTAAGATCATCAAAATGCATAAATGTATGGAGAAGACCAGCTTACCTTTTGTTATGGCTACTTCAAGACTTCTACCCAGTGTTCCTGTGAACTTTATTTCTTATTGCTTGGACAAGACAACCAAGACTAAGTGTGACTTCTTGTTTCTTCTGTCTGAGATGAGCTCCCTGCATCTTTGTGTATTTGGACATTTGGTTTCTGGTAAAATTAGTAATAATCAAGCTCTTAAGGTCAACAAGGAAGAAAACTGCAATCGGCCTCAGTACTCTGAAGAGTTCTTGATGCTTCTGCCAACTGTTCTGTTATACTTGAGGTCAAATTTTCTGAAATTTGGGGGCCAATTTGGCAAGCATGTTGAAAACACTTCTTCTTTCTTTTGGAAGATCCTTTTGCGTGGTTTCTCTAACTGGAAGAGTTTTGTTTCGGAAGAGATATTTGAGATAAAACTTGTTGAGTGCTCATCTTTATGCATGGAAGATTTTTCTAACCTTTTCTCTTCCAGTCTTCTTGGAAAAGCAGTACTGCTGATGCGTCATTACCTTGCTGTGAGTGGACACTTGGTGAAAATGAAAAGGCTATTGAGTACATTTGATTCTGTTTGCCCACATGCGAGTGCACAGAATGATCTTCTGGACTGCGATGCTAGAGAAATTGGTGTTTGTTCTCTTGAGTTGTCTTTGAACTTTGTGAACAAAATTATTGCAAAGATATGCCTCTGTTGGATGTTGTTATTTCCAGAGCATAATAATCTTCAATCTGTAGTGAAAGATGGAAAGAAAAAAGGAATTGAATCAGAAGTTAGCATTTTGAGAATCCGATTTTTAAGTATGCTGGTCCATTCATGGCAACGTCTTGTGGAGAATTTTCATACATGCAGGCAAGGAGAGAACATAAGGTCGTCATTGTTTAGATTCTTGGAGATCTTCATTGCTAAGAATATAGTAGCATTGGTAAGAGAAATGCATGATTGCCTGGTTGAATTGCATTCGCTTCCTTTCTTAGACCAACTTGCCAAATATTCTCTTCTTCATAGGTTTGATGACCCTACCACAATTAGGATGCTTAGAATTGTTCTTATTTCACTATCTGAGGGAAAGTTCTTGTGCATTTCAATTCTCCAGCTGTTACTTGCTCACTCTCAATTTGCTCCAACCATTCTATTTGCCCATTCATCAACTGTTTGTACTCAATTTGGTATGAGTTTTGCTCCGGCACCCAGCATTATGAGGTTATTTACTGTTCTTCATACTGAAGAAAACACGGTTGATGGAAAAAAGGATGCTCATGAAACTGGGCCTCACATGAAGAAGTTGGAACTGATTAAGTTGCTCAGAGTACTAATACATATCTTGGGTCAGCAACATTATCTTGATTCTGAAACATCCAATGGCTTAAATTTGAAGGAATTGGTTTTGGTGCTTTTGTCTTCTTATGGAGCAACCATGGATGAGATTGATTTGGAAATGTATAGCCTCATGAATGAAATTGAGGCTATTGATAAATCAGTCTCTGAAGGTATTGCTGAAATGGATTTTCTATGGGGCTCTGCTTCTCTGAAGGTGAGACAAGAAAGGGAACAAAAGCAAAGTGTATCTTCTTTGAGTAACTCATATGATAATGAAGTAGTTGGAGAGAGACGAAGGATTCAATTTAGAGAAAATCTTCCCATTGACACCAAATTATGTGCAATGACAGTCCTTTGTTTTCCTCATGATAGATTTGCTGATGGGAGCTTGAGCAAGCTCCAAACAAATGATTCTGATGAGGGCTACAATGCAAATTCTAAGAAGGTGCAACTTTATGATCCAGTTTTCATCTTGCGTTTTTCAATTCACAGTCTTGCAATGGAGTATATTGAGCCCCTGGAGTTTGCTAGTTTGGGTTTGCTTGCAATTACATTTATCAGTTTGTCTTCTCCTGATGCTGATACAAGGAAATTGGGCTATGAGGCTGTTGTGAGATTTAAGAGTGCTGTGGAGAAATGTCGCAAGAGGAAGGATGTGATGCGACTCCGGCTCTTAGTATCATACTTGCAAAATGGTATAGAAGAAGAGTGTCAGAGGATTCCTTCCATAACTGCTGTATTCATTGCGGAAGCTTCTTTTGTTCTGTTAGATTCTTCCCATGATCATTATTCAGCTATAAGTAAATGCCTGATGCGGTCATCAGGTGCTAATATGAAGGGTGTACCATTATTCCAAGAATTCTTCTGGAGTAGCTCTGTTACTTTTAAGTCAGAAAGGTTGTGGATGCTTCGGCTTTTAAACACATCTCTGACTATGGATGATGATGCTCAAATACTTGTCAGAAATTCCATTTTTGAGATCCTTTTAAATTTTTATGCCTCTCCTCTTTCCGATGACGAGTCAAAGGAACTGATCGTTGAGATGGTGAAAAAGTCCGTCAAAATAAATAAGCTTGCATGGCATTTGGTTGTACGCTGTGGCATAATTTCTTGGCTGTCTTCTCATGTTGCATCTTTTTACGGGATTCTACTCAGGGACCAGAGAAGTTTTTCATTTGCTAAGTTAGCTATGGTTCTGGAGGTAGCCAATGATGTTATTATGTCTAGAAATACTAGTGAGTGGTTGCAAAAATATGCCCTAGAGCAGCTTTCTGAACTTGCAGCTCATCTGTACAGAATCTTAGTTGGTTGTTCTAAACATATACAAGAGAAAACCAGAATCATTGATTTGATTCTAGAACTATTGATGTCAACCCTGAAGATCTCACAGAAAAGAAAAATATATCAGCCGCATTTTACAATATCTTTTGAAGGTTTATACCATTTGTACGAAGCTGTTGATGTCTGTTGCAGTGGGACCTTCAGTTCTACTGCTGAGATTGGACTGAAAGCTGTCCTTATGAGTACTCCTCCAGTTTCTATACTTCACATGGATAAAAATAAGCTTTTGAAGTTTGTTAGCTGGGCAATATCAACTGCTGTGCAGTCAAACTTGATGGAGGTGCCTGAATCTGAAGCAATGTATAGCAATGCCTTGAGATTTTCAGAACAATCTGAAGAGGATCTTGTATCAAAGCTTTTAAGATGGCTGACTGCCTCAGTGATTCTTGGAAGGCTTTCATGGAAATTGAGTGATTTGAATTCCACTAGTTCTTCTGAATATTAA
Protein:  
MGDLYEELNSKVAKRQKAVLLLLASIVRRGPGLAWEVAKGFDFKTGNFSKLAEWKARGNEGMRRYLTRKEFVGFAMSFLEVGNPRLLRGILQQKDMYSGVLRGLGNDDEEIVVYVLLTLRNRVLVPESLVPPGLRSVLFGSATLEQLISISGRQDGGLAAEVAHSVLVMVCTDPSNGLMPDLERQPNPLKGNVKRLVDLMKKLKPTEVEYHKDLLLAIVKGRPAFGSAYLENFPHNLEDLASPNWFSAISLAADVMSSVGDGFTCAYVNSQSQEPPSIDNLIVQDIMKCIGPRPFTRLVMNKGLLHSDPLVKHVTLRLVSEELKLLDFLIGSVNDLSSSSDQVMHKWASFKRDVQNVVQILLPDPQVLLSLLSSLSGYCKSPASRMKRAADVDVTVEHNLHKKKKLKMNSVDEDMDILVSGVSSTTEGALTENDGVSEEDVEDQLNSGVDLLKPVLEIWGLQGCSSVDIRTEDGDTYFYSKLLDVLRIYHRTLPTAVEGSFDFFKVLPSNPLALPTILQQSMLSLLVEQVVGSNKSQISIRTQPLMYKYLHSFINLFMYSPIRDIKDQAYSLAQAAMLSTGAFDRNPREISAWFLFIPGYTSVVIDGQKHGIEVFQKLSSVVISFLCDAVSTTGNNLFKYLDLLRGYIRDLEFLQVWVLLVDLHGERFTSGSIWKTQTLSVYLRLLLTDSAILAPFHSLCTGEKCLRLLSSETGSFTLPEKSMISLYVSTTLKYLLETQVEGGLLCSLTQLLISERLKGCCDMIGFCPCEWMPMNSLLYFARNVQQQIYSSFMSEEKATGLGGSFSETLSEVNRILRTKDHCGLLGVTMGFSFSMICTTADQILQNFPSTISTSTKLLGVPFSILLLRFFLEPSHFAEVFKLWPKICFAGVDKVISGVHDGEGQTIANELDDSPDSASIAFSFLVKNAPFHVLFPAIFFTDGLHLLGHSKVQNLLLDKFTESTPDFSVSSLCRLLFCLLQARLAYRIKPSDELEKLCESSCFLAKHIVKQSFVEKFGPDCSPRVLPPLSSGHIREVAEIILGHPLLTALLEWPLHTDNDVGDMIFMKPPETFLQYAERGVRKIDHHILQLLRRTTSELLVHVFSKCRSPSVVDHSTERIAKAFKALVQKLFLTFKARFTDSRKTDDLMPLIPTLYALHSLSEFICPFELLNLVHWLFSRIDLNDTAVSISCQRCGLSVGLQIASWAFDSLSLYMLEPHAKRTLFNFFMGTGNRSFEITLFERIFNSIFEIATHTQLEVADICLFKAVKIIKMHKCMEKTSLPFVMATSRLLPSVPVNFISYCLDKTTKTKCDFLFLLSEMSSLHLCVFGHLVSGKISNNQALKVNKEENCNRPQYSEEFLMLLPTVLLYLRSNFLKFGGQFGKHVENTSSFFWKILLRGFSNWKSFVSEEIFEIKLVECSSLCMEDFSNLFSSSLLGKAVLLMRHYLAVSGHLVKMKRLLSTFDSVCPHASAQNDLLDCDAREIGVCSLELSLNFVNKIIAKICLCWMLLFPEHNNLQSVVKDGKKKGIESEVSILRIRFLSMLVHSWQRLVENFHTCRQGENIRSSLFRFLEIFIAKNIVALVREMHDCLVELHSLPFLDQLAKYSLLHRFDDPTTIRMLRIVLISLSEGKFLCISILQLLLAHSQFAPTILFAHSSTVCTQFGMSFAPAPSIMRLFTVLHTEENTVDGKKDAHETGPHMKKLELIKLLRVLIHILGQQHYLDSETSNGLNLKELVLVLLSSYGATMDEIDLEMYSLMNEIEAIDKSVSEGIAEMDFLWGSASLKVRQEREQKQSVSSLSNSYDNEVVGERRRIQFRENLPIDTKLCAMTVLCFPHDRFADGSLSKLQTNDSDEGYNANSKKVQLYDPVFILRFSIHSLAMEYIEPLEFASLGLLAITFISLSSPDADTRKLGYEAVVRFKSAVEKCRKRKDVMRLRLLVSYLQNGIEEECQRIPSITAVFIAEASFVLLDSSHDHYSAISKCLMRSSGANMKGVPLFQEFFWSSSVTFKSERLWMLRLLNTSLTMDDDAQILVRNSIFEILLNFYASPLSDDESKELIVEMVKKSVKINKLAWHLVVRCGIISWLSSHVASFYGILLRDQRSFSFAKLAMVLEVANDVIMSRNTSEWLQKYALEQLSELAAHLYRILVGCSKHIQEKTRIIDLILELLMSTLKISQKRKIYQPHFTISFEGLYHLYEAVDVCCSGTFSSTAEIGLKAVLMSTPPVSILHMDKNKLLKFVSWAISTAVQSNLMEVPESEAMYSNALRFSEQSEEDLVSKLLRWLTASVILGRLSWKLSDLNSTSSSEY